个性化热图如此简单?加分组指定基因标签什么的简直小case!

用于绘制热图的R包有很多,类似大家熟悉的heatmap、pheatmap、ComplexHeatmap包,从基础热图到稍复杂的个性化热图基本靠上述这三个基本都能拿捏,相关的教程可戳我们往期的推文。

今天强烈安利一个基于ggplot2版的热图绘制R包ggheatmap,相比ComplexHeatmap包来说,使用起来不能更简单,还可结合ggplot2的丰富主题参数进行美化,赶紧学起来!

为了适应聚类树的粗细,导出尺寸设置为12×12(inches),可以看到字号有些过小了,我们留到最后通过主题一次性改完,这里先过掉。

除聚类树之外的组件,在本案例中也就是plotlist1-plotlist3,我们可以结合ggplot2的theme进行主题样式的自定义。

给平时用惯了ggplot2绘图的朋友们安利这个R包,使用起来会非常顺手,效果也狠不错!好啦,今天的分享就到这里!